Tras la muerte de Alfonso IX en 1230 el Reino de León será heredado por sus hijas Sancha y Dulce, aunque Fernando III les comprará dicha Corona a cambio de una elevada renta anual, titulándose Rey de León, el cual unirá a su título de Rey de Castilla obtenido en 1217, si bien la Corona Leonesa y la Castellana seguirán teniendo instituciones y leyes diferentes.  

El Reino de León perderá poderío e importancia dejando de ser la Ruta de la Plata, además se unirá la condición de frontera de León con Portugal, reino con el que se estará en constante conflicto. Alfonso X el Sabio dejará en su testamento separadas las dos Coronas si bien su hijo Sancho tomará por la fuerza la Corona Leonesa, rompiendo el testamento de su padre. 

A la muerte de éste Don Juan se proclamará Rey de León en 1296 tras la rebelión estallada en Zamora, Benavente y Villalpando en pro de la separación leonesa, gobernando oficialmente y de manera separada el Reino de León hasta 1301. Más tarde, habrá una serie de intentos más para separar las coronas de León y Castilla como las de Juan el Tuerto o Alfonso Enríquez aunque serán sofocados, comprando los reyes las voluntades de la nobleza leonesa dándoles tierras y separando además el territorio asturiano del Reino de León en 1388 creando, de este modo, el Principado de Asturias, que servirá de título para el heredero del trono leonés, al igual que ocurrirá con los principados de Viana y Gerona para los herederos de los reinos de Navarra y Aragón.